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200年来化学家首次实现原子级实时分辨为化学反应拍视频

来源:高分子科学前沿 2127 2019-08-30

在自媒体短视频盛行的当下,化学反应也期望拥有自己的专属视频。


然而这谈何容易!化学反应在微观层面可能瞬息万变,且所涉及原子体积微小(10-10m数量级)、种类繁复。为化学反应定格瞬间已是举步维艰,遑论获取视频了。200年来,化学反应的原子级可视化一直是梦幻泡影。


如今,原位观察化学反应已不再是梦想!日本东京大学中村荣一教授课题组近日在《自然·通讯》上发表了一种名为SMART-EM(single-moleculeatomic-resolution real-time electron microscopy)的技术。该技术基于透射电子显微镜,成功拍摄了具有原子级分辨率的两种金属-有机框架材料——MOF-2和MOF-5——在生长初期形成结构迥异的前驱晶体的过程。


将反应物固定于电子束的焦点,但又不影响反应的正常进行,是获得原子级分辨率化学反应视频的关键。为此,研究者们制备了一种碳空心管,并在管尖端附近通过共价键接上对苯二甲酸形成锚定反应物的“鱼钩”。由于对苯二甲酸分子是构成MOF-2和MOF-5分子的必要原料,两种MOF均可在碳管表面生长,使得在原子水平观察MOF生长过程成为可能。



图1. SMART-EM样品“鱼钩”。(a)MOF前驱晶体(PNC)在表面修饰有对苯二甲酸碳空心管(BDC-CNH)尖端附近生长的化学反应。(b和c)BDC-CNH的(b)SMART-EM图像和(c)模型示意图。白色箭头指示表面的对苯二甲酸基团。图片来源:Nature Communications。


作者们利用SMAT-EM技术观察到MOF-2和MOF-5分子在N,N-二甲基甲酰胺(DMF)中生长初期产生的前驱晶体形貌大相径庭。95°C下,反应形成MOF-2。Zn2+-对苯二甲酸配合物形成链式分子及四元环。除此之外,作者们未观察到具有更高对称性的分子。而当加热到120°C时,反应形成MOF-5。此时,部分Zn2+-对苯二甲酸配合物形成具有高对称性的三维立方体结构。随着反应时间延长,立方体前驱晶核数量提升。264秒后,三维立方体稳定形成。作者们认为造成两种温度下前驱晶体形态差异的原因与溶剂DMF热分解产生O2-离子有关。



图2. MOF-2视频第19秒图像分析。(a)SMART-EM实际图像;(b)模拟电镜图像;浅蓝色和紫色虚线圈分别标注锌离子和垂直于屏幕的苯环。(c)翻转90°后的分子结构模拟意图;(d)基于图(a)的分子结构模拟图。红、浅蓝、深蓝和灰球分别代表氧、锌、氮和碳。图片来源:Nature Communications。



MOF-5前驱晶体生长。来源:NatureCommunications。


图3. MOF-5前驱晶体的结构。(a)SMART-EM图像;(b)模拟电镜图像;浅蓝色和紫色虚线圈分别标注锌离子和垂直于屏幕的苯环。(c)基于图(a)的分子结构模拟图。红、浅蓝、深蓝和灰球分别代表氧、锌、氮和碳。图片来源:Nature Communications。


虽然视频的清晰度尚待提升,但笔者坚信通过科学家们持之以恒的努力,各类化学反应的高清视频终将刷爆学术界朋友圈。原野幸治教授(文章共同通讯作者)在东京大学的采访中提及其团队早在2013年便观察到了立方体型的MOF-5前驱晶体。文章发表前,他们花了整整一年时间来说服审稿人认可他们的成果。


更多细节请见原文:https://www.nature.com/articles/s41467-019-11564-4

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